特定の地域だけ全国一律の規制とは違う制度を認める「構造改革特区」のひとつ。国際物流特区は沖縄県が唯一「国際物流支店拠点産業集積地域」として設けている。主な内容としては税関の執務時間の延長、保税蔵置場の設置緩和、重量物輸送の制限緩和、物流産業の集積、税制優遇などが挙げられる。